昌都水系属外流水系，主要河流有怒江、澜沧江、金沙江及其支流，是中国及亚洲东南部主要河流的上游集结区之

   昌都水系属外流水系，主要河流有怒江、澜沧江、金沙江及其支流，是中国及亚洲东南部主要河流的上游集结区之一，河流众多，水网发育。大小河流分属于太平洋和印度洋两大水系。怒江为萨尔温江的上游，该流域属印度洋水系。澜沧江、金沙江两条大河属太平洋水系，其中金沙江为长江上游，最终注入东海；澜沧江为东南亚著名河流——湄公河的上游，流经横断山脉地区，最后注入南海。此外，位于昌都西南部的然乌湖是帕隆藏布江的源头，属雅鲁藏布江水系，它最终流入印度洋。

  昌都的水系格局受到地质构造和外营力因素的控制，但在各河的不同河段表现出明显的差别。怒江、澜沧江、金沙江源自青藏高原腹地，它们进入昌都逐渐转变近南北走向，这3条亚洲南部最大的河流汇聚本区，形成了举世闻名的“三江并流”奇观，其最窄处，由怒江经澜沧江至金沙江的直线距离公68千米，其具体位置在盐井南南西藏与云南交界的北纬28°25°25.6’处。由此向南金沙江率先转向东南，并向东奔去。因此，真正的“三江并流”奇观是在昌都完成的，是昌都所特有的。由于本市受青藏高原第四纪以来强烈隆起的影响，上述三条大江及其支流的下游河段强烈切割，在地貌上形成了相对起伏达1000-2000米以上的深切大峡谷，“三江并流、平行岭谷”成为昌都市特有的地貌景观。怒江、澜沧江、金沙江的河流与水文特点不仅对本区，而且对整个青藏高原和东亚都有重要的意义。

昌都的地表径流受区域气候条件、地貌与植被、土壤垂直地带分布特征的影响，年径流地区分布趋势为自西向东减少，山地大于河谷，迎风坡大于背风坡，其特点与年降水理地区分布趋势相一致。本区大多数河流补给主要是雨水和地下水，冰雪融水补给仅在本市的西、南边缘地区怒江和雅鲁藏布江的支流源头。本市河流水量较丰富，据水文间观测结果推算：昌都市的多年平均出境水量为2530.2立方每秒，年径流量797.2亿平方米。季节分配的地区径汉的年际变化不大，最大水年平均流量与多年平均流量的比值最小为1.17，最大为2.24，平均为1.46。最小水年平均流量与多年平均流量的比值，全区平均为0 .7左右。地区河川径流的年内分配与年际变化与河流的径流补给关系最为密切。在本区各类径流补给中，由于地下水和冰雪融水占一定比重，因而径流年际变化较小，又由于年内降水集中，使得以雨水为主要补给的河流其径流年内分配很不均匀。